RPostgreSQL Installationsfehler - RPostgreSQL.so: undefiniertes Symbol: PQpass

Question

Ich versuche das R-Package RPostgreSQL zu installieren, erhalte aber den folgenden Fehler:

Fehler beim Laden der Bibliothek /usr/lib64/R/library/RPostgreSQL/libs/RPostgreSQL.so:
undefiniertes Symbol: PQpass
Fehler: Laden fehlgeschlagen
Ausführung abgebrochen
FEHLER: Laden fehlgeschlagen
* Lösche ‘/usr/lib64/R/library/RPostgreSQL’

Ich habe libpq und postgresql-dev installiert. Alle Bibliotheksdateien befinden sich im Verzeichnis

/usr/lib64/pgsql/ und alle Header-Dateien im Verzeichnis

/usr/include/pgsql/

Postgre Version - 9.3.4 R Version - 3.0.2 Betriebssystem - CentOS-6.4

Ich übersehe etwas Kleines, kann aber nicht herausfinden, warum das passiert.

Was mache ich falsch? Wie kann ich das korrigieren?

Answer 1

Es sieht so aus, als wären die pgsql-Bibliotheken nicht mehr an ihren bisherigen Standorten installiert. Ich habe beide verlinkt:

ln -s /usr/pgsql-9.3/lib /usr/lib/pgsql

ln -s /usr/pgsql-9.3/include /usr/include/pgsql

Dies hat bei mir funktioniert :)

Answer 2

Das Paket RPostgreSQL überprüft nur in den folgenden Verzeichnispfaden auf PostgreSQL-Bibliotheken:

    /usr/lib 
/usr/lib/pgsql 
/usr/lib/postgresql 
/usr/local/lib 
/usr/local/lib/pgsql 
/usr/local/lib/postgresql 
/usr/local/pgsql/lib 
/usr/local/postgresql/lib 
/opt/lib 
/opt/lib/pgsql 
/opt/lib/postgresql 
/opt/local/lib 
/opt/local/lib/postgresql 
/opt/local/lib/postgresql84 
/sw/opt/postgresql-8.4/lib 
/Library/PostgresPlus/8.4SS/lib 
/sw/lib

Es überprüft nicht die Verzeichnisse entweder in LD_LIBRARY_PATH oder in /etc/ld.so.conf.

Die Installation von RPostgreSQL wird also nur erfolgreich sein, wenn die PostgreSQL-Bibliotheken in einem der oben genannten Verzeichnisse existieren.

Als ich die Bibliotheken von /usr/lib64/pgsql nach /usr/lib/pgsql kopiert und versucht habe, das Paket zu installieren, hat es funktioniert. :)