Nur die Quellen eines Pakets und alle Abhängigkeiten herunterladen

Question

Ich frage mich, ob es eine Möglichkeit gibt, die install.packages() oder andere verwandte Funktionen, um Folgendes zu tun: nur die Quellen herunterladen (d.h. tar.gz Dateien) der angegebenen Pakete und aller ihrer Abhängigkeiten in einen bestimmten Ordner (unter Windows).

Ein Grund dafür ist: Angenommen, ich habe ein Linux-Konto, das nicht für den Internetzugang aktiviert ist. Um die Pakete auf dem Linux-Rechner zu installieren, würde ich zuerst alle benötigten Quellen auf meinem Windows-Rechner herunterladen, sie dann per FTP auf den Linux-Rechner übertragen und sie auf dem Linux-Rechner installieren, indem ich

  install.packages('/home/me/R/Packages/blah.tar.gz', repos = NULL)

Answer 1

Ich hatte kürzlich ein Problem, bei dem ich alle Abhängigkeiten herunterladen wollte, und ich habe es so gelöst:

Angenommen, ich möchte alle Abhängigkeiten und Importe von ggplot2 y MASS :

getPackages <- function(packs){
  packages <- unlist(
    tools::package_dependencies(packs, available.packages(),
                         which=c("Depends", "Imports"), recursive=TRUE)
  )
  packages <- union(packs, packages)
  packages
}

packages <- getPackages(c("ggplot2", "MASS"))

Ich kann jetzt die Pakete in ein anderes Verzeichnis herunterladen.

download.packages(packages, destdir="whereyouactuallywantthefiles", 
                  type="source")

Wenn Sie von dort aus ein lokales Repository auf Ihrem Linux-PC erstellen möchten, folgen Sie den Anweisungen aquí .

Answer 2

Versuchen Sie download.packages(c("xts", "rms"), "c:/TEMP", .....) 代わりに install.packages() ; Sie können ihm im 2. Argument direkt ein Zielverzeichnis angeben.

Mehrere Jahre später bearbeiten: Wie bereits in anderen Antworten und Kommentaren erwähnt, wurden inzwischen mehrere Hilfsfunktionen zu den R-Paketen tools und utils hinzugefügt. R 3.4.0 wird haben tools::CRAN_package_db() zum Herunterladen der obersten Ebene PACKAGES.rds Datei (und natürlich können Sie auch einfach die download.file() y readRDS() auch dafür).

Answer 3

Hierfür gibt es jetzt bessere Möglichkeiten in der Werkzeuge Paket, das mit der Basisversion von R geliefert wird: package_dependencies() . Siehe zum Beispiel die Antwort von @sebastian-c und diese aktuelle Fragen und Antworten für einen verwandten Anwendungsfall.

---

Es gibt eine nicht exportierte getDependencies() Funktion im Paket utils. Ich habe nicht studiert, wie es funktioniert, aber die Kombination mit @Dirk's Antwort sollte Sie die meisten der Weg dorthin zu bekommen.

Grundsätzlich scheint es aber so zu sein, dass Sie es wie folgt verwenden:

utils:::getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib)

donde pkgs ist der Zeichenvektor der zu installierenden Pakete, dependencies ist ein Zeichenvektor der gewünschten Arten von Abhängigkeiten (Depends, Enhances usw.), available ist die Ausgabe von available.packages() y lib ist der Bibliotheksort für die Pakete, in denen die Abhängigkeiten ausgewertet werden.

Wenn Sie Debuggen install.packages() Es macht im Grunde genommen die getDependencies() Schritt dann @Dirk's download.packages() bevor es mit der eigentlichen Installation beginnt.