Hier scheint eine Antwort für diejenigen zu fehlen, die SSH für die Verbindung zu ihrer MySQL-Datenbank verwenden. Sie müssen zwei Stellen überprüfen, nicht nur eine, wie in anderen Antworten vorgeschlagen:
Workbench Bearbeitungseinstellungen SQL-Editor DBMS
Workbench-Voreinstellungen bearbeiten SSH-Zeitüberschreitungen
Meine standardmäßigen SSH-Timeouts waren sehr niedrig eingestellt und verursachten einige (aber offensichtlich nicht alle) meiner Timeout-Probleme. Vergessen Sie danach nicht, MySQL Workbench neu zu starten!
Zuletzt kann es sich lohnen, Ihren DB-Administrator zu kontaktieren und ihn zu bitten, die Eigenschaften wait_timeout & interactive_timeout in mysql selbst über my.conf + mysql restart zu erhöhen oder eine globale Einstellung vorzunehmen, wenn ein Neustart von mysql keine Option ist.
Ich hoffe, das hilft!