Ich bin ein Hobby-Programmierer und bin in beiden Sprachen "durchschnittlich". Ich finde es einfacher, schnellen Fortran-Code zu schreiben als C- (oder C++-) Code. Sowohl Fortran als auch C sind "historische" Sprachen (nach heutigem Standard), werden stark genutzt und haben gut unterstützte freie und kommerzielle Compiler.
Ich weiß nicht, ob es eine historische Tatsache ist, aber Fortran fühlt sich so an, als sei es dafür gebaut, parallel/verteilt/vektorisiert/was-auch-immer-viele-Kerne-zu-sein. Und heute ist es so ziemlich die "Standard-Metrik", wenn wir über Geschwindigkeit sprechen: "skaliert es?"
Für reines Cpu Crunching liebe ich Fortran. Für alles, was mit IO zu tun hat, finde ich es einfacher, mit C zu arbeiten (es ist in beiden Fällen sowieso schwierig).
Für parallelen, mathematikintensiven Code wollen Sie wahrscheinlich Ihre GPU verwenden. Sowohl C als auch Fortran haben eine Menge mehr oder weniger gut integrierter CUDA/OpenCL-Schnittstellen (und jetzt auch OpenACC).
Meine einigermaßen objektive Antwort lautet: Wenn man beide Sprachen gleich gut/schlecht beherrscht, dann denke ich, dass Fortran schneller ist, weil ich es einfacher finde, parallelen/verteilten Code in Fortran zu schreiben als in C. (sobald man verstanden hat, dass man "freeform" Fortran schreiben kann und nicht nur strengen F77-Code)
Hier ist eine 2. Antwort für diejenigen, die mich abwerten wollen, weil ihnen die 1. Antwort nicht gefällt: Beide Sprachen haben die erforderlichen Funktionen, um Hochleistungscode zu schreiben. Es hängt also von dem Algorithmus ab, den Sie implementieren (rechenintensiv ? io-intensiv ? speicherintensiv?), von der Hardware (Single-CPU ? Multi-Core ? verteilter Supercomputer ? GPGPU ? FPGA ?), von Ihren Fähigkeiten und letztendlich vom Compiler selbst. Sowohl C als auch Fortran haben großartige Compiler. (Ich bin wirklich erstaunt, wie fortschrittlich Fortran-Compiler sind, aber das sind C-Compiler auch).
PS: Ich bin froh, dass Sie Libs ausdrücklich ausgeschlossen haben, denn ich habe viel Schlechtes über Fortran-GUI-Libs zu sagen :)