Sicher, das können Sie auf jeden Fall tun. Allerdings müssen Sie Ihre Anwendung in C++ schreiben.
Gehen Sie dazu auf Datei | Neu, und wählen Sie unter Projekttypen eine der Optionen unter Visual C++. Für die minimalen Abhängigkeiten würde ich eine der Win32-Optionen vorschlagen. Sowohl die Option "Win32-Konsolenanwendung" als auch die Option "Win32-Projekt" führen Sie zum gleichen Assistenten. Wenn Sie auf der linken Seite auf Anwendungseinstellungen klicken, können Sie auswählen, ob Sie eine Konsolenanwendung oder eine Windows-Anwendung erstellen möchten. Eine Konsolenanwendung wird in einem Konsolenfenster wie cmd.exe ausgeführt, während eine Windows-Anwendung anfangs keine Benutzeroberfläche hat (Sie müssen die Benutzeroberfläche selbst erstellen).
Auch wenn Sie nicht von der .NET-Laufzeitumgebung abhängig sind, müssen Sie die CRT-DLLs auf den Rechnern, auf denen Ihr Programm ausgeführt wird, verfügbar haben. Die Redistributables für diese Dlls befinden sich im Visual Studio-Installationsverzeichnis, das bei einer Installation im Standardverzeichnis C:\Program Dateien \Microsoft Visual Studio 9.0 \VC\redist.